Chụp cắt lớp vi tính ruột non có dùng ống thông là phương pháp xâm lấn tối thiểu, có hiệu quả hơn khi tìm kiếm các bất thường tại thành ruột. Người bệnh sẽ được đặt thêm một ống thông vào góc tá hỗng tràng để bơm nước trước khi bắt đầu chụp cắt lớp vi tính.

Cộng hưởng từ ruột non là phương pháp chẩn đoán hình ảnh đặc biệt, giúp bác sĩ quan sát được chi tiết cấu trúc các quai ruột non từ đó chẩn đoán được chính xác các bệnh lý như: áp xe ruột non, tắc ruột, biến chứng bệnh Crohn và các bệnh viêm ruột khác.