Viêm khớp thiếu niên tự phát thể hệ thống khá đặc trưng bởi các triệu chứng tổn thương nội tạng kèm theo sốt cao điển hình, cùng các tổn thương lan rộng ngoài khớp như trên da, mạch máu, tim, phổi, gan, lách, hạch…, từ đó ảnh hưởng nghiêm trọng đến sức khỏe.