Giải trình tự bộ gen, thông tin sinh học ( ví dụ:, sự phong phú tương đối) của hệ vi sinh vật kết hợp đã tạo ra một cuộc cách mạng trong cách chúng ta nghĩ về cơ thể “con người” về sức khỏe và bệnh tật. Sự tương tác giữa vi khuẩn đường ruột và hệ thống miễn dịch của vật chủ đóng vai trò quan trọng trong cơ chế bệnh sinh của các bệnh đường tiêu hóa, bao gồm cả những bệnh ảnh hưởng đến thực quản.

Điều trị chứng loạn khuẩn đối với các bệnh lý thực quản như viêm thực quản trào ngược,... các bệnh lý liên quan khác thông qua bổ sung prebiotics, probiotics và kháng sinh. Từ đó giúp giảm loạn khuẩn, cải thiện tỷ lệ gram dương đến gram âm đối với các bệnh thực quản.