Phẫu thuật cắt đoạn ruột non ( thường là hơn 2⁄3 chiều dài của ruột non) làm giảm hấp thụ gây ra hội chứng ruột ngắn. Mỗi bệnh nhân sẽ xuất hiện các triệu chứng khác nhau tùy thuộc vào độ dài và chức năng của phần ruột non còn lại, tuy nhiên tình trạng tiêu chảy có thể trở nên nghiêm trọng và suy dinh dưỡng diễn ra khá phổ biến.