Cộng hưởng từ ruột non là phương pháp chẩn đoán hình ảnh đặc biệt, giúp bác sĩ quan sát được chi tiết cấu trúc các quai ruột non từ đó chẩn đoán được chính xác các bệnh lý như: áp xe ruột non, tắc ruột, biến chứng bệnh Crohn và các bệnh viêm ruột khác.