Một số khuyết tật thông liên nhĩ được chẩn đoán trước hoặc ngay sau khi đứa trẻ được sinh ra. Tuy nhiên, tình trạng nhỏ và không đáng kể có thể không được chẩn đoán mà cần phải có hướng điều trị bệnh thông liên nhĩ về sau này.