Trào ngược dịch mật là căn bệnh rất dễ bị nhầm lẫn với bệnh trào ngược dạ dày thực quản. Đây là hai căn bệnh hoàn toàn khác biệt. Việc điều trị tình trạng trào ngược dịch mật khá khó khăn so với bệnh trào ngược dạ dày thực quản.