Viêm đại tràng giả mạc có thể gây ra một loạt các biến chứng nguy hiểm khi trở nặng như suy kiệt cơ thể, lượng kali trong máu thấp bất thường, mất nước do tiêu chảy. Thậm chí, tình trạng này có thể gây thủng ruột kết dẫn đến nhiễm khuẩn ổ bụng. Do đó, việc chẩn đoán và điều trị sớm là rất cần thiết để tránh nguy hiểm tới tính mạng.