Viêm tụy cấp là biến chứng chính của cắt cơ vòng Oddi. Tăng áp lực trong ống dẫn trứng, lấp đầy quá mức hệ thống ống dẫn, khó đông và lặp đi lặp lại ống tụy gây co thắt và chấn thương đều được coi là các yếu tố căn nguyên, có thể do ảnh hưởng đến sự dẫn lưu ống tụy.