Lấy bệnh phẩm là bước đầu tiên và cũng là quan trọng nhất trong cả quá trình xét nghiệm Vi sinh, lấy bệnh phẩm đúng sẽ cho kết quả chính xác.và ngược lại. Trong khi đó vi sinh vật lại có mặt ở mọi nơi nên lấy bệnh phẩm rất dễ bị ngoại nhiễm.