Hệ sinh dục của bé trai và bé gái khác nhau nên việc vệ sinh vùng kín ở bé trai cũng khác so với vệ sinh cho bé gái. Để tránh nhiễm trùng phụ huynh cần giúp bé làm sạch vùng kín mỗi khi tắm hoặc thay tã. Độ tuổi của bé và việc bé đã cắt bao quy đầu hay chưa cũng ảnh hưởng đến cách thức vệ sinh.