Với một số bệnh phổi như ung thư phổi, u phổi... thì phương pháp điều trị hiệu quả hiện nay là phẫu thuật cắt phổi không điển hình do bệnh lý, có thể là phẫu thuật cắt một phân thùy thổi hay phẫu thuật cắt một thùy phổi bệnh lý. Tùy vào tình trạng sức khỏe bệnh nhân và giai đoạn của bệnh phổi mà sẽ có những chỉ định điều trị nhất định trong từng trường hợp cụ thể.