Niêm mạc ruột được xem như một hàng rào quan trọng, nơi hàng triệu vi khuẩn và kháng nguyên tiếp xúc với hệ miễn dịch. Các vấn đề xảy ra ở hàng rào đường ruột này có thể dẫn đến nhiều tình trạng tiêu hóa khác nhau, như bệnh viêm ruột, bệnh celiac...