Flucytosine được sử dụng để điều trị nhiễm trùng nấm nghiêm trọng trong cơ thể. Flucytosine thuộc vào nhóm thuốc chống nấm. Nó thường được sử dụng với các loại thuốc khác, hoạt động bằng cách làm chậm sự phát triển của một số loại nấm.