Chỉ tự tiêu có thể được sử dụng để khâu vết thương hoặc vết mổ phẫu thuật. Một số vết thương hoặc vết mổ được khâu lại bằng việc dùng các mũi khâu tự tiêu ở bên dưới bề mặt, một số trường hợp khác có thể không dùng được chỉ tự tiêu. Tỷ lệ khâu vết thương bằng chỉ tự tiêu để lại sẹo cao hơn khâu bằng chỉ thường nên chúng thường được sử dụng khâu trong. Các mũi khâu bằng chỉ tự tiêu sẽ tự biến mất vào một khoảng thời gian nhất định.