Sốt rét ác tính thể não gây các rối loạn thần kinh, nổi bật là rối loạn hành vi, rối loạn ý thức, hôn mê, co giật, liệt,... Đó là các biểu hiện của các tình trạng tắc mạch não và thiếu oxy não, toan lactic... gây nguy hiểm cho người bệnh.