Sàng lọc hội chứng Klinefelter bằng các chẩn đoán xâm lấn, cần chọc ối hay sinh thiết nhau thai tiềm ẩn nhiều nguy cơ sảy thai, dị tật thai nhi. Xét nghiệm ADN thai nhi trong máu mẹ NIPT là phương pháp chẩn đoán mới, an toàn, là lựa chọn sàng lọc hội chứng Klinefelter trước sinh hiệu quả.