Căn nguyên tiêu chảy có thể do vi khuẩn, virus, định hướng căn nguyên của tiêu chảy có thể phụ thuộc vào độ tuổi, tình trạng miễn dịch. Tiêu chảy ở người suy giảm miễn dịch như tuổi cao, có các bệnh lý nền ( suy thận, tăng huyết áp, tiểu đường, ung thư ...) có thể do nhiều nguyên nhân gây ra. Trong số đó, Cytomegalovirus thường ít được quan tâm đến.