Quy trình siêu âm qua thực quản có thể khiến bạn cảm thấy khó chịu trong khi tiến hành và đau họng nhẹ 1 - 2 ngày sau đó. Tuy nhiên, việc siêu âm tim qua thực quản không có nguy cơ gây ra bất kỳ tác động xấu nào cho cuống họng hay thanh quản của bạn cả.