Cắt đoạn trực tràng thường áp dụng cho các trường hợp u trực tràng đoạn 1⁄3 trên và 1⁄3 giữa. Đây là quá trình phẫu thuật cắt bỏ phần trực tràng và mạc treo trực tràng. Sau đó, lập lại lưu thông đường tiêu hoá bằng nối đại trực tràng bằng máy nối cơ học.