Trào ngược dạ dày thực quản có thể dẫn đến những biến chứng nguy hiểm như hẹp thực quản, barrett thực quản hay thậm chí là ung thư thực quản. Do đó, cần phát hiện, điều trị càng sớm càng tốt, mổ nội soi tạo van chống trào ngược dạ dày thực quản là phương pháp điều trị tối ưu nhất.