Bất kỳ một phương pháp phẫu thuật nào cũng đều có thể xảy ra tai trong và sau khi phẫu thuật. Đối với mổ nội soi hỗ trợ điều trị đau dây thần kinh số V, tai biến hay gặp nhất gồm: Rò nước não tủy, chảy máu, dập não, chảy máu màng mềm, tổn thương dây thần kinh,...