PCNL vẫn còn một số nhược điểm về nguy cơ chảy máu, đau sau mổ và thời gian nằm viện còn dài. Nội soi thận qua da đường hầm nhỏ (Mini - PCNL) dựa trên nguyên lý thu nhỏ tối đa đường hầm vào thận và sử dụng dụng cụ kích thước nhỏ cho phép giảm đau, hạn chế chảy máu và rút ngắn thời gian nằm viện.