Khối phổ (Mass Spectrometry-MS) là một kỹ thuật để đo tỉ lệ khối/điện tích của các ion (mass to charge-m/z). Từ kết quả về khối lượng và cấu trúc đó, chúng ta có thể biết về chức năng sinh học của phân tử được phân tích. Khối phổ 2 lần (Tandem Mass Spectrometry-MS/MS) còn chỉ ra các thành phần hoá học ở nồng độ thấp thậm chí rất thấp trong hỗn hợp phân tích.