Vật liệu di truyền của virus viêm gan C là RNA chuỗi đơn. Người bệnh có thể xét nghiệm viêm gan C để tìm HCV RNA dương tính sau khoảng 2 tuần phơi nhiễm virus, sớm hơn rất nhiều so với xét nghiệm tìm kháng thể anti-HCV. Xét nghiệm định lượng HCV RNA thực hiện bằng phương pháp PCR có độ nhạy cao, có thể giúp phát hiện virus HCV ngay cả khi nồng độ trong máu còn rất thấp.