Những xáo trộn trong hệ vi sinh vật đường ruột phá vỡ cân bằng nội môi của niêm mạc và có liên quan chặt chẽ với IBD ở người và viêm đại tràng ở chuột. Do đó, ngăn ngừa hoặc điều chỉnh sự mất cân bằng của hệ vi sinh vật có thể được coi là một chiến lược phòng ngừa hoặc điều trị mới cho IBD.

Probiotics là một chủ đề nóng hiện nay, đặc biệt là đối với những người mắc hội chứng ruột kích thích (IBS).Hội chứng ruột kích thích là một bệnh mãn tính gây đau bụng và thay đổi thói quen đi tiêu. Nhiều người dùng chế phẩm sinh học với hy vọng rằng việc cân bằng vi khuẩn đường ruột sẽ cải thiện các triệu chứng của họ.