Nếu các phương pháp điều trị bằng thuốc không đem lại hiệu quả hoặc xuất phát từ nhiều nguyên nhân khác nhau, các bác sĩ sẽ chỉ định cắt đoạn điều trị viêm loét dạ dày - tá tràng, tránh các biến chứng nguy hiểm xảy ra cho người bệnh.