Viêm tụy tự miễn là một nguyên nhân không phổ biến của viêm tụy mãn tính và tái phát. Nó xảy ra do quá trình tự miễn dịch chính của tuyến tụy hoặc là thành phần thứ cấp của rối loạn tự miễn hệ thống.