Anti Ds DNA là tự kháng thể có giá trị cao trong chẩn đoán một số bệnh lý tự miễn như lupus, xơ cứng bì hệ thống...Hiện nay, do có độ nhạy cao nên xét nghiệm anti Ds DNA thường được sử dụng trong chẩn đoán bệnh lupus ban đỏ hệ thống.