Thuốc kháng sinh không giúp ích cho nhiều bệnh viêm đường hô hấp dưới do vi rút gây ra. Trong khi viêm phế quản cấp tính thường không cần điều trị bằng kháng sinh. Nhóm kháng sinh điều trị viêm đường hô hấp dưới chủ yếu được dùng cho những bệnh nhân có đợt cấp của viêm phế quản mãn tính hay viêm phổi. Theo đó, chỉ định của thuốc điều trị viêm đường hô hấp dưới do vi khuẩn được lựa chọn bằng cách xem xét tuổi của bệnh nhân, mức độ nghiêm trọng của bệnh và sự hiện diện của bệnh tiềm ẩn.