Cơ sở của phương pháp xét nghiệm điện di huyết sắc tố là xem xét các phân tử tích điện hoà tan hay là phân tán trong chất điện giải có dòng điện đi qua. Sau khi thực hiện xét nghiệm điện di huyết sắc tố thì sẽ tách riêng được các loại hemoglobin. Từ đó có thể hỗ trợ xác định đó là loại hemoglobin nào và nó chiếm tỷ lệ bao nhiêu phần trăm trong mẫu máu.