Phần lớn các trẻ bị teo mật bẩm sinh cần phải ghép gan. Teo mật bẩm sinh là chỉ định ghép gan phổ biến nhất ở trẻ sơ sinh và trẻ em. Trong thời gian hiện nay, ít nhất 60 đến 80 phần trăm bệnh nhân bị bị teo mật bẩm sinh sẽ cần ghép gan, ngay cả khi được quản lý tối ưu.