Phương pháp siêu âm trong mổ được các bác sĩ chỉ định trong trường hợp kết hợp điều trị giữa cắt tổn thương với phá hủy các khối u trong mổ hoặc sử dụng phương pháp này trong các trường hợp có ca phẫu thuật phức tạp, đòi hỏi cân nhắc các các phương pháp điều trị.

Siêu âm trong mổ được hội chẩn áp dụng khi gặp trường hợp phẫu thuật phức tạp, cần cân nhắc về phương pháp điều trị. Kỹ thuật siêu âm trong mổ có thể kết hợp điều trị giữa cắt tổn thương với phá hủy các khối u trong mổ (có thể phá hủy bằng sóng cao tần, tiêm cồn tuyệt đốt, áp lạnh, vi sóng...).