Có kinh nghiệm 39 năm học tập và làm việc trong lĩnh vực ngoại nhi tổng quát. Tốt  nghiệp Đại  học Y Hà  Nội năm 1983, PGS Hậu về công tác khoa Ngoại, Bệnh viện Nhi Trung Ương. Ông được đề bạt vào vị trí Phó trưởng khoa sau là phụ trưởng trách khoa và đã có nhiều năm đảm nhiệm chức vụ này. Ông đã hoàn thành khóa học BS CKI, CKII và hoàn thành luận án Tiến sĩ tại trường Đại học Y Hà Nội năm 2011; được công nhận học hàm Phó Giáo sư năm 2015. Ông cũng có thời gian đi học tại một số nước phát  triển trên thế giới về  phương  pháp giảng dạy, nghiên cứu khoa học, bồi dưỡng chuyên môn Nhi khoa.

Bên cạnh lĩnh vực chuyên môn, PGS.TS Bùi Đức Hậu còn được đánh giá cao trong công tác quản lý, giảng dạy, nghiên cứu khoa học. Với vai trò Phó khoa Ngoại trong nhiều năm, ông đã cùng các đồng nghiệp phát triển các kỹ thuật cao, đặc biệt là phẫu thuât nội soi, ghép tạng, tách nhiều cặp song sinh dính nhau thành công. PGS. TS Bùi  Đức Hậu đạt danh hiệu “Thầy thuốc Ưu tú” năm 2010; bằng khen của Thủ tướng Chính phủ năm 2005  và 2013; bằng khen của Bộ Y tế năm 2009, 2011 và 2013; “Chiến sĩ thi đua cấp Bộ” năm 2011 và 2014, danh hiệu “Thầy thuốc Nhân dân” năm 2017.